基因不同：藍玫瑰是轉(zhuǎn)基因的花種，花瓣是自身的顏色，可以遺傳；藍色妖姬是人工的花卉，通過后期染色制成。生產(chǎn)方式：藍玫瑰主要通過種植，引進純種的轉(zhuǎn)基因株系來生產(chǎn)；藍色妖姬是將白粉色的玫瑰用染色劑染色。顏色區(qū)分：藍玫瑰自然，不易褪色。藍色妖姬的藍色與著色劑的種類密切相關(guān)，容易褪色。

從基因上來看

藍玫瑰是一種轉(zhuǎn)基因的花種，科學(xué)家將其它花的一種能主司產(chǎn)生藍色素的基因通過基因工程技術(shù)轉(zhuǎn)入月季花體內(nèi)，導(dǎo)致這種新品種月季花可以大量產(chǎn)生藍色素，使得其花朵藍得非常自然。

花瓣的藍色可以遺傳。

藍色妖姬是一種人工的花卉，一般是由廠家和花店將其它淡顏色的薔薇科花朵染為藍色制成，并沒有基因水平上的改變。

花朵的藍色不能遺傳。

從生產(chǎn)方式來看

藍玫瑰的生產(chǎn)主要來自于種植。農(nóng)業(yè)中通過引進純種的轉(zhuǎn)基因株系進行種植，成熟后收獲種子再進行大量繁殖。

藍色妖姬的生產(chǎn)方式與藍玫瑰大有不同。工廠或者花店通過購入白色或者粉色的月季或者玫瑰，利用染色劑直接對成花進行染色。

從顏色上看

藍玫瑰的藍色非常自然，顏色鮮艷，嬌艷欲滴，而且不易褪色。

藍色妖姬的藍色與著色劑的種類密切相關(guān)，不同廠商生產(chǎn)的藍色妖姬往往呈色差別很大，有的藍色非常淺，有的甚至藍的發(fā)黑。這種之后染上的藍色不僅色彩不自然，而且容易褪色。

從作用上看

藍色玫瑰的不但可以作為制藥的原材料生產(chǎn)治療月經(jīng)不調(diào)、痛經(jīng)等疾病的藥物，而且可以用于煉制植物精油。從它花瓣中提煉的油芬芳怡人，可以用于生產(chǎn)視頻或者化妝品。

藍色妖姬除了兩者都有的觀賞作用以外，基本沒有其它作用。不過藍色妖姬作為長期以來深受喜愛的玫瑰界寵兒，有著自己特有的人文價值，代表著戀人之間純潔的愛。至今關(guān)于藍色妖姬的文化作品層出不窮，不僅有書和音樂，而且還有相關(guān)主題的電影。